检查中发现，主要存在几大类问题，比如企业职工薪酬核算管理不规范；部分上市公司存在收入成本不实、滞缴漏缴税金等违规问题；部分外资、民营企业存在会计核算不规范、人为操纵利润等问题。
针对检查发现的问题，各地财政部门依法作出了处理处罚，追缴税款7.25亿元，对单位处以罚款4034万元，对115名直接责任人员给予了罚款、吊销会计从业资格证书等行政处罚。
■ 案例
神华集团 发千万福利未纳税
部分单位少缴企业所得税、营业税，少代扣代缴个人所得税，如神华准格尔能源有限责任公司2011年发放补贴和实物福利4145万元，未代扣代缴个人所得税。
部分单位存在少计提和超规定范围使用煤炭生产安全费、煤矿维简费等，如中国神华(15.70, 0.13, 0.83%)煤制油化工有限公司所属神木化学工业有限公司在安全生产费中列支员工奖励732万元。
天津松江(7.83, -0.25, -3.09%)股份公司 需补税金4亿
检查发现，该公司存在少计资产1.2亿元、少计负债1.2亿元等会计违规问题，少缴各项税款5.6亿元。其中该公司及下属子公司截至2011年末，未按规定申报缴纳营业税及其附加1.9亿元、土地增值税1.5亿元、企业所得税2.08亿元。
针对问题，财政部驻天津市财政监察专员办事处依法下达了处理决定，补交税金4亿元，并已制订另外1.6亿元未缴税金的清缴计划。
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