当前，我国现代煤化工面临四个不可忽视的重大问题：
一是盲目发展问题突出。许多地方和企业都把现代煤化工作为投资的重点，导致现代煤化工项目十分庞大。据统计，目前已经开展前期工作和规划的新项目有53个，产能合计约3300万吨。
二是产能同质化现象严重。当前，已建成和正在建设的现代煤化工项目大多停留在煤制甲醇、煤制烯烃、煤制乙二醇等产品上。以煤制烯烃为例，后加工项目大多集中在聚乙烯、聚丙烯少数几个通用料的品牌上。
三是水资源制约严重。目前，我国现代煤化工项目用水量较大，每吨煤制油需要耗水5.8~9吨、煤制天然气8.1吨、煤制乙二醇25吨、煤制烯烃22~32吨。这些项目主要分布在宁夏、陕西、内蒙古等中西部地区，当地煤炭丰富，水资源匮乏。
四是环保排放压力很大。在“三废”排放中，现代煤化工项目固体废弃物和二氧化硫等废气处置相对容易，高浓度含盐废水和二氧化碳排放是污染治理的两大难点。
李寿生针对现代煤化工发展的宏观政策，提出了三条建议。第一要从严把关项目审批，防止出现盲目上马的无序局面。第二要强化创新组织工作，培育一批产学研用等优势的国际化项目。第三要实施优惠政策和建立标准体系。
当前煤化工发展的主要任务是要继续搞好示范，推进产业融合发展，推进大气环境污染防治，提高技术、装备成套能力，规划建设好煤化工产业六大基地，稳步推进国际合作，积极探索二氧化碳减排。
