资源税改革方案由财政部税政司牵头制定，国家税务总局财产行为税司配合。全国煤炭主产省区——山西、陕西、内蒙等对改革提出了意见，中国煤炭工业协会以及部分煤炭企业也参与了改革调研和讨论。
财新记者获悉，综合考虑地方政府、行业协会、企业等所提意见，煤炭资源税由“从量定额”改为“从价定率”征收后，税率区间为2%-10%之间。
“在国务院最后决定出台前，方案都有可能发生变化。”财政部、国家税务总局官员称。
目前实施的《资源税暂行条例》由国务院于1993年制定颁布，按“从量定额”的办法计征，即按资源品销售量乘以单位税额计算纳税，企业纳税不会随资源价格波动而变化。
资源税中的煤炭税目分为两个子税目，其中，对焦炭按每吨8元-20元征税，其他煤炭按每吨0.3元-5元征税。
“煤炭资源税改为‘从价定率’征收后，中央会确定一个税率区间，具体按多少征，由地方根据本地情况在区间范围内确定。”国家税务总局官员告诉财新记者，资源税是地方税种，各省区差异也比较大，中央会给地方政府一定的灵活权。
改革后，若以“从价定率”2%-10%的税率征税，煤炭企业按每吨500元销售，需缴纳资源税10元-50元，将比目前最高每吨5元的税负上升2倍至10倍。
仅从资源税这一个税种衡量，煤炭企业的税负并不高。资源税从1994年施行，煤炭每吨0.3元-5元的定量税额，当时煤价仅为每吨几十元，此后20年煤价上涨超过10倍，最高时接近20倍。煤炭资源税占煤价的比重不足1%。
但是，在此期间，针对煤炭的收费和基金等非税收入逐年升高，煤炭企业实际整体税费负担偏高。
据国家发改委官员引用的调查数据，各种涉煤税费一般占企业营业收入的25%-35%，个别地区甚至更高。
煤炭企业缴纳的各种税费中，除了依法依规征收的税金、政府性基金和行政事业性收费外，部分地方政府违反涉企收费有关规定的收费项目占相当一部分比重。
作为拟定政府非税收入管理制度和政策的主管部门，财政部综合司司长欧文汉曾公开表示，将采取取消、整合、改税、转经营等措施，全面清理规范收费基金。结合推进资源税改革，将取消涉及矿产资源的矿产资源补偿费、价格调节基金等。
“煤炭资源税改革的关键，是税负怎么设计得好。”国家税务总局官员称，资源税改革要考虑方方面面，改革时机的确不好掌握，通货膨胀时担心加剧物价上涨，经济不好时担心企业困难。
这位官员称，目前煤炭企业困难，地方政府的“胃口”反而不会太高，会把税率定得低一点。现在要“清费正税”一起搞，煤炭企业税费负担整体上可能会有所降低，这样企业可能也愿意。
2013年11月，国务院发文承诺“切实减轻煤炭企业税费负担”，提出“在清理整顿涉煤收费基金的同时，加快推进煤炭资源税从价计征改革”。
国务院这一“清费正税”的思路，就是在改革煤炭资源税计税依据、提高资源税税负的同时，煤炭企业的整体税费负担不能提高。
