浸矿细菌分布广泛，可能存在于土壤、水和空空气中。而相对集中的地方是金属硫化矿和煤矿的酸性矿坑水，所以采集这些细菌的最佳采样点是煤矿、铜矿、铀矿等有酸性矿坑水的地方。将配制好的固体培养基倒入培养皿中制成平板，然后在无菌操作下，用接种环取上述培养液，在平板上划线分离，使取液中的细菌细胞尽量沿划线分散，然后在25-30℃恒温培养划线培养皿。10天左右，可以看到一个由单个菌株长出的棕色小菌落(可以用解剖显微镜观察)。选择合适的菌落，转移到装有几毫升培养基的小试管中恒温培养。一般7天左右培养液就能变成红棕色。