世界上主要采用生物氧化(浸出)法处理目标矿物，如搅拌氧化法、堆浸法、槽浸法、废石堆浸法和原地浸出法。

1.搅拌氧化(浸出):

为生物氧化法制造的带有搅拌和曝气装置的罐被用作氧化目标矿物的反应器。该方法投资大、成本高、控制水平高、操作难度大，但与其他氧化方法相比，该方法效率最高，综合效益好。

2.原矿的堆浸(氧化)

粉碎的原矿被堆浸或粒化并堆浸以氧化目标矿物。该方法投资少，成本低，适用于从低品位原矿中回收有用金属，但有用金属回收率低。堆浸是目前应用最广泛的浸出方法，特别是在低品位硫化铜矿的回收中。

3.沐浴

浸没是在处理过程中将被浸没的材料部分或全部浸没在溶液中的一种方法，以便有用的金属能被浸出。这种方法主要用于处理以前选矿产生的尾矿。这些尾矿中含有的有用金属，当时由于技术原因或经济原因没有回收，但现在可以经济地回收。

4、废石堆浸

废石堆浸是指有用金属含量极低的采矿废石堆浸。即使不人工使用，自然条件也会导致生物氧化，产生酸性废水，对环境造成危害。废石堆浸方法与原矿基本相同，只是原矿堆浸需要倒置，而废石堆浸不需要倒置。例如，中国德兴铜矿采用生物浸出技术和堆浸法处理露天剥离的含铜废石(含铜0.09%)。

5.原地浸出

生物沥滤用于在现场处理压碎的矿石，而不需要将开采的矿石运输到地表进行处理。但这种方法只适用于矿体下有天然不透水层，且无严重破碎和断层的情况，以避免溶液中有用金属的渗漏损失或溶液中有毒物质对地下水的污染。这种方法对即将开采的老矿是有利的。例如，中国的中条山金属公司采用原地浸出法回收铜。