曲靖自然资源丰富。已探明矿产资源30处，煤、铁、磷、铝、铅、锌、硫等储量居全省前列。其中，煤炭种类齐全，质量优良，已探明可采储量近100亿吨，占全省储量的1/3。原煤和炼焦煤产量占全省的40%以上。还有全省最大的硅藻土、硫铁矿等矿床。有30多种国家和省级保护植物和国家珍稀动物。有37种国家和省级保护植物，如树蕨、野生山茶、玉兰和辣椒树。被列为国家珍稀保护动物的有30种，如大灵猫、猕猴、水獭、黑熊、金猫、金钱豹、黑斑羚、黑颈鹤等。人均水资源高于全国水平，水电资源开发潜力巨大。

曲靖矿产资源丰富，主要有煤、铅、锌、铁、磷、重晶石、萤石等，其中以煤、铅、锌为主。煤炭资源远景储量达276亿吨，占全省的52%，炼焦煤约占全省的96.5%；富源老厂优质无烟煤矿区被称为“中国江南第一大煤田”。锌及稀有金属量360万吨，远景储量800万吨，居云南第二位；磷预测储量63亿吨，探明储量10亿吨，居云南第二；铁矿储量占全省的80%”；天然气探明储量4亿吨以上，占全省的4/5。